秦始皇苦苦追寻“长生不老药”而最终死于东巡途中，古往今来，无数人在追寻长寿的路上前进，多少未竟的事业由于伟人离世而失败。在皇帝成长计划2中，一局游戏开始于皇帝即位，结束于皇帝驾崩，许多玩家的宏图伟业也未能完成，徒留“先帝创业未半而中道崩砠”。而炼丹便是一个游戏中有效延长游戏时间，有着各种特殊作用的独特系统。
炼丹可以从游戏的西殿-青炉房进入，游戏中一共有12种材料，在制造丹药时也需要按顺序进行放置，炼制丹药后需要等待七七四十九天（两个月）之后才能查看结果。如果在此期间选取可以获得双倍丹药的思想，第三个月也可以直接过去双倍的丹药数量。
稀有材料可以通过友好国家进贡、索要、角落里的人、打猎、钓鱼、出游来获取，根据材料的特性，所获取的位置也各不相同。不过天材地宝获取概率都要偏低一些。
药方为了方便，将以数字序号表示所需材料（游戏内序号）：
1.不化神冰 2.千年参王 3.鲸王凝脂 4.高僧舍利 5.龙蜒麝香 6.玉面首乌
7.五彩雪莲 8.透光灵芝 9.炽火金蟾 0.灵龟板 11.黄金锦鲤 12.天青水玉
提升寿命：
l益寿延年丹
配方1345967
游戏中玩家最常用的丹药，可以直接增加皇帝一年的寿命。
l天地长寿丹
配方7674823
游戏第二种可以增加寿命的丹药，大体材料与益寿延年丹相近，但也有一些材料做出了改变。
而两种菜品都需要五彩雪莲、鲸王凝脂、织火金蟾。
提升魅力：
l丰胸木瓜丸
配方8679132
增加妃子、公主一点魅力。
l易容方
配方8989436
随机改变妃子、子女、皇帝的立绘图片，魅力也会随机变动，推荐给魅力较低的角色使用。
l奇妙面膜
配方9877512
相比易容方，奇妙面膜更为稳定，可以由玩家指定一个立绘编号直接变为指定立绘，魅力也会随之改变。
l魅力丹：
配方(12)312846
魅力丹虽然不会直接提升玩家魅力值，但获得的效果不数魅力值所带来的增益，缺点是时限仅有一回合，有两种效果：
n当玩家在养心殿休息时，会触发宫女随机事件。
n发现名妃概率提升。
子嗣药品：
l安胎药
配方2826856
怀孕期间不会生病不会流产。
l滑胎药
配方5652595
直接流产，如果已使用安胎药则无效。
l九转迷魂香
配方432511（比其他丹药少一种材料）
增加怀孕几率，如果拜访太后有概率获得温情酒，功效与九转迷魂香相同。
l速孕汤
配方6457933
立刻怀孕，最大的用处是可以照顾女性玩家，让男宠也能立刻怀孕。
l多胞胎药丸
配方6453777
毕竟生出多胞胎
l避子汤
配方5559992
绝育，妃子永远不会怀孕，不清楚与速孕汤同时使用的效果。
l天机丹
配方(11)498165
让妃子生出的后代属性整体提升，只能在怀孕期间使用，注意玩家吃了无效。
属性药品：
l人杰丹
配方0378915
本回合内增长的属性翻倍，使用后其他药品提升也将翻倍。
l勇武丹
配方0629549
提高自身武力值30点，如果大臣使用则提升三点。(皇帝大臣属性比10：1)
l博学丹
配方(11)561316
提高文学属性30点，大臣使用提高三点。
l才艺丹
配方(12)989466
提高才艺属性30点，大臣使用提高三点。
毒药：
蕴毒丹
配方2347891
任何角色使用直接死亡，在玩家需要赐死的时候使用。
其他：
冰糖雪梨
配方1111111
需要七个不化神冰炼制。好喝，无任何作用。
